捷克电影和斯洛伐克电影在新浪潮期间的不同之处主要体现在以下几个方面：

1. 叙事性与风格：捷克新浪潮电影通常具有更强的叙事性，并且由于这些导演是国有电影业的继承者，他们有更多机会接触电影制片厂和国家资助[1]。相比之下，斯洛伐克电影可能在这方面有所不同，但具体信息较少。

2. 现实主义与个人表达：捷克新浪潮电影强调现实和个人，电影语言中对白与独白起到了重要作用，使人物性格变得鲜活[3]。而斯洛伐克电影在这方面的特点没有明确的区分描述。

3. 政治与社会背景：捷克新浪潮影片在60年代动荡的政治背景下，表现出意大利新现实主义、法国新浪潮和直接电影的影响[2]。斯洛伐克电影可能也受到了类似的影响，但具体表现可能有所不同。

4. 文化与审美：捷克新浪潮电影开始尝试在镜头下呈现“一种真实的经验，一种新的、有别于资本主义的社会主义文化”[13]，而斯洛伐克电影在这方面的描述不多。

5. 黑色幽默与荒诞色彩：捷克电影新浪潮带有很强的黑色幽默和荒诞色彩，表达出了一代青年的情感和思想[14]，斯洛伐克电影在这方面的特点没有明确的区分描述。

综上所述，捷克和斯洛伐克电影在新浪潮期间虽然都属于同一地区的电影运动，但捷克电影的特点更为明显和突出，而斯洛伐克电影的特点则相对较少被提及和分析。这些差异可能与两国不同的历史、文化和社会背景有关。

参考来源：

1. 捷克斯洛伐克新浪潮- 维基百科
2. 真实的荒诞——浅析捷克斯洛伐克新浪潮影片的现实主义流变 - 豆瓣
3. 浅析二十世纪六十年代捷克电影新浪潮的特点 - 参考网
4. 捷克新浪潮电影与文学文本关联阐释 - 参考网
5. 永远的反对派：“捷克电影新浪潮”最重要旗手伊日·门泽尔去世 - 网易