1475年土耳其人征服狄奥多罗后，希腊人的宗教和教会组织得以保留的原因主要与奥斯曼帝国的“米利特”制度有关。这一制度允许非穆斯林臣民按照宗教区分开来，并给予一定程度的自治。希腊人以及其他信奉东正教的被统治者（如阿尔巴尼亚人、保加利亚人）在宗教、文化、教育等方面享有一定的自治权。这种政策使得希腊人的宗教和教会组织得以保留并继续发挥作用。此外，保留希腊人的宗教和教会组织也有助于奥斯曼帝国维持对新征服地区的稳定和控制。因此，土耳其人征服狄奥多罗后，希腊人的宗教和教会组织得以保留，这与奥斯曼帝国的宗教政策和统治策略密切相关。