萨尔瓦多独立后长期由地主寡头控制的原因可以从以下几个方面进行理解：
历史背景和政治结构：根据维基百科的资料，萨尔瓦多在1838年中美洲联邦瓦解后独立，由于地理位置的限制，政权长期由地主寡头控制[1]。中国社会科学院拉丁美洲研究所的研究指出，独立后，军事领袖和地主集团首领成为新独立国家的独裁统治者，即第一代考迪罗[2]。
经济依赖和出口单一：萨尔瓦多的出口长期单一为染料，这导致经济依赖于少数出口产品，使得地主寡头能够通过控制这些出口产品来维持其权力和影响力[1]。
土地私有化和自由主义改革：19世纪中叶到20世纪初，中美洲五国包括萨尔瓦多在内，开启了以土地私有化为核心的自由主义改革。在这场改革中，民众赖以生存的土地被地主阶级与商业寡头攫取，从而加强了他们的经济和社会地位[7]。
军事和政治的结合：在独立后，军事领袖和地主集团首领结合，成为独裁统治者，这种结合使得地主寡头通过军事力量来维持其政治控制[2]。
国际影响和国内政策：洪都拉斯对萨尔瓦多的寡头政治制度有很大的影响，几万名萨尔瓦多的农民移民被洪都拉斯野蛮驱逐出境，这个结果不但使萨尔瓦多的统治阶级更加巩固其权力[8]。
综上所述，萨尔瓦多独立后长期由地主寡头控制的原因是多方面的，包括历史背景、政治结构、经济依赖、土地私有化改革、军事和政治的结合以及国际影响等。这些因素共同作用，导致了地主寡头在萨尔瓦多的长期统治。
[1] https://zh.wikipedia.org/zh-cn/%E8%90%A8%E5%B0%94%E7%93%A6%E5%A4%9A%E5%8E%86%E5%8F%B2 [2] http://ilas.cass.cn/kyziyuan/kylmgl/201902/t20190218_4827439.shtml [7] http://www.360doc.com/content/22/0601/12/16295112_1034096727.shtml [8] https://www.marxists.org/chinese/fourth-international/marxist.org-chinese-FI-198502B.htm