米兰在伦巴第同盟中获得特殊地位的原因，以及这一地位所引发的城市间冲突，可以从以下几个方面进行理解：
皇帝的偏袒：根据维基百科的资料，米兰因其受到皇帝的偏袒而获得了特殊地位[1]。这种特殊地位使得米兰在同盟中拥有更多的权力和影响力。
与克雷莫纳的冲突：米兰的特殊地位引发了与其他城市，尤其是克雷莫纳的冲突[1]。这种冲突可能源于对权力和资源的争夺，以及对同盟内部领导地位的竞争。
同盟的重组：伦巴第同盟在其存在期间经历了多次重组，这表明同盟内部的权力结构和城市间的关系是动态变化的[1]。
城市间的权力斗争：在中世纪，城市间的权力斗争是常见的现象。米兰的特殊地位可能加剧了这种斗争，导致与其他城市间的紧张关系和冲突[2]。
教区和伯爵的冲突：在伦巴第地区，米兰教区的兴盛与当地伯爵的权力发生了冲突，特别是在曼托瓦、科莫和克雷莫纳等地[2]。
综上所述，米兰在伦巴第同盟中的特殊地位是由皇帝的偏袒造成的，这种地位引发了与克雷莫纳等城市间的冲突，这些冲突可能与权力、资源的争夺以及对同盟内部领导地位的竞争有关。
[1] 维基百科，自由的百科全书：伦巴第同盟 [2] 维基百科，自由的百科全书：[意大利王国(神圣罗马帝国)](https://zh.wikipedia.org/zh-cn/%E6%84%8F%E5%A4%A7%E5%88%A9%E7%8E%8B%E5%9B%BD_(%E7%A5%9E%E5%9C%A3%E7%BD%97%E9%A9%AC%E5%B8%9D%E5%9B%BD)