基因研究揭示美洲原住民祖先的迁徙历史主要通过以下几个发现：
基因流事件：一项研究显示，智利、巴西和伯利兹11000年前到9000年前的最古老人群与美国最古老个体存在联系，表明克洛维斯人的遗传祖先进一步向南扩展[1]。
D4h谱系：中国科学院的研究人员追踪了一个古老人类谱系D4h，存在于线粒体DNA中，表明美洲原住民的亚洲历史[2]。
古DNA分析：研究团队通过整合现代人群和古DNA大数据，发现“中国南方人”与最早的美洲原住民存在深度的古老祖源遗传联系[3]。
单一迁徙事件：基因组证据显示，美洲原住民祖先可能在一次单一迁徙事件中进入美洲大陆，抵达时间约是2万年前[4]。
分支分化：研究人员的数据显示，美洲原住民的祖先在大约1万3000年前分成两枝，与冰川融化和进入北美内部路径开放的时间相吻合[5]。
Y染色体分析：基因学家通过对美洲印第安人和亚洲人群Y染色体的研究，发现了明显的基因相似性，表明美洲印第安人可能与亚洲人群有共同的祖先[6]。
这些基因研究结果为我们提供了美洲原住民祖先迁徙历史的深刻见解，揭示了他们与亚洲人群的联系以及迁徙过程中的重要事件。
[1] 古DNA揭示美洲人的“根” - 新闻- 科学网
[2] 新研究发现：美洲最早的一些人类来自中国 - 上观
[3] 古DNA线索，牵出美洲原住民的东亚源头 - 科技日报
[4] 新证据“诉说”美洲原住民祖先迁徙故事-新华网
[5] 基因数据提示美洲原住民的祖先是如何及在什么时候进入美洲
[6] 美洲印第安人是不是从中国移民？探讨迁徙与历史渊源