伊萨克·科穆宁与弟弟曼努埃尔一世之间的关系紧张，主要源于继承权的问题。根据搜索结果中的信息，伊萨克·科穆宁是约翰二世的第三子，由于他的长兄和次兄相继逝世，按照继承顺序，他本应继承皇位。然而，约翰二世临终时选择了曼努埃尔作为继承人，而非伊萨克，原因是伊萨克性格急躁，被认为不适合为帝[1]。此外，曼努埃尔在对抗塞尔柱突厥人的战争中表现出色，这也可能是他被选为继承人的原因之一[1]。因此，伊萨克对于未能继承皇位可能心怀不满，这导致了他与曼努埃尔一世之间的关系紧张。
参考来源： [1] 百度百科 - 曼努埃尔一世：https://baike.baidu.com/item/%E6%9B%BC%E5%8A%AF%E5%9F%83%E5%B0%94%E4%B8%80%E4%B8%96/8295421