明朝中期的政治斗争对皇帝与大臣之间的关系产生了深远的影响。以下是一些关键点：
权力斗争与内阁分权：明朝中期，内阁权力的增长与皇帝权力的相对减弱导致了两者之间的紧张关系。例如，在嘉靖至万历初期，皇权信任和默许下，阁权得到极大发展，特别是严嵩、张居正当国期间，阁权全面碾压部权，阁臣“赫然为真宰相，压制六卿”[4]。这种权力的集中加剧了朝政的混乱和权力斗争。
皇帝怠政与官僚体系腐化：万历皇帝三十年不出宫，导致朝政运行缺乏最高权威的指挥，官僚体系逐渐懒散腐化；同时，内阁大臣们的权力过于集中，导致权力斗争加剧[2]。这种怠政行为使得皇帝与大臣之间的关系更加疏远。
立太子之争与君臣关系紧张：万历朝中期，因立太子之争，君臣关系紧张，终致皇帝怠政、官员腐化，明朝开始走向衰败[3]。这种紧张关系直接影响了朝政的稳定和皇帝对大臣的信任。
宦官权臣与皇权的关系：宦官权臣的存在对皇权构成了挑战，但也在一定程度上限制了皇帝的行动。对于像张居正那样的当朝丞相来说，虽然在一定程度上限制了皇帝的行动，但其忠臣之心的根本并没有动摇[7]。
综上所述，明朝中期的政治斗争导致了皇帝与大臣之间关系的紧张和疏远，权力斗争的加剧和皇帝怠政的行为进一步加剧了这种紧张关系，影响了明朝的政治稳定和国家的长远发展。