勃艮第公国在百年战争中与英格兰结盟，后来又转向法兰西王国的原因可以从以下几个方面来理解：
政治和权力的争夺：百年战争的核心是英格兰和法兰西之间关于法兰西王位的争夺。勃艮第公国作为法兰西的一部分，其公爵在权力斗争中扮演了重要角色。根据维基百科的描述，勃艮第公国在百年战争中被迫退出巴黎，投靠英国，站在了法国王室的对立面，其支持英国王子亨利继任法国王位。
独立性的追求：勃艮第公国追求独立性，这导致其在英法之间摇摆以获取最大的政治利益。如中国历史研究院所述，勃艮第公国在百年战争中支持英国王子亨利继任法国王位，这显示了其试图通过与英格兰结盟来增强自身的独立性和影响力。
战略和地缘政治的考量：勃艮第公国的地理位置使其成为英法争夺的重要对象。根据欧陆风云4百科，勃艮第公国在影响力、收入甚至军事力量上已经可以匹敌很多王国。通过在英法间施展权谋唆使对立，勃艮第历代公爵都维持着事实上的独立。
战争进程和局势变化：随着百年战争的进程，勃艮第公国的立场也发生了变化。如虎扑社区所述，英格兰因此失去唯一且非常重要的盟友。虽然法兰西看似处在胜利的势头上，战局却停滞了近二十年。查理虽然在1436年收复巴黎，但1439年，勃艮第公国和英格兰私下和谈，从战争中退出。
综上所述，勃艮第公国在百年战争中的立场变化是出于对权力、独立性、战略和战争局势变化的综合考量。其与英格兰结盟以及后来转向法兰西王国，都是基于当时政治环境和自身利益的需要。