阿尔及利亚的犹太人在1962年独立后大多选择移居法国的原因主要有以下几点：
法国公民身份：根据搜索结果中的维基百科，大多数阿尔及利亚的犹太人之前已获得法国公民身份，这使得他们在阿尔及利亚独立后能够选择移居法国。
经济和政治上的不平等：维基百科中提到，黑脚（指那些在阿尔及利亚出生的法国公民）和阿尔及利亚穆斯林之间的分歧根植于两者在经济和政治上的不平等，这种不平等可能导致犹太人选择离开。
社会排斥：澎湃新闻的文章提到，黑脚在阿尔及利亚独立后遭到排斥，被视为“阿奸和叛徒”，这种社会排斥可能促使犹太人离开。
宗教和文化认同：阿尔及利亚独立后，伊斯兰主义兴起，试图以穆斯林来定义全体阿尔及利亚人，这可能使得犹太人感到自己的宗教和文化认同受到威胁，从而选择移居法国。
安全考虑：独立战争期间及之后，阿尔及利亚的安全局势可能对犹太人构成威胁，这也是他们选择移居法国的一个原因。
综上所述，阿尔及利亚犹太人在1962年独立后大多选择移居法国，是由于他们拥有法国公民身份、经济和政治上的不平等、社会排斥、宗教和文化认同的威胁以及安全考虑等多方面因素的综合作用。