南朝陈时期，越南地区的地理建置难以考索的原因可能与当时的政治局势有关。根据维基百科的资料，南朝时期由于军权转移，皇族主要出身于寒门或庶族，导致皇帝与宗室为了皇位时常发生血腥斗争[1]。这种内部的权力斗争和政治不稳定可能使得对边疆地区的控制和管理变得困难，从而影响了地理建置的记录和保存。
此外，由于战略错误与北朝军力强盛，南朝的疆界逐次南移，这也可能导致了对越南地区控制的减弱，使得相关地理建置的资料难以保留下来[1]。这种政治局势的动荡和边疆控制力的减弱，不仅影响了地理建置的记录，也反映了当时南朝政权的不稳定和对外控制力的下降。
总的来说，南朝陈时期越南地区地理建置难以考索的现象，反映了当时南朝政权内部的动荡和对外控制力的不足。这一时期的政治斗争和疆界的南移，共同导致了对边疆地区，包括越南地区在内的地理建置记录的缺失。
[1] 南北朝 - 维基百科，自由的百科全书: https://zh.wikipedia.org/zh-cn/南北朝