圣元奶粉被怀疑与婴儿性早熟有关的原因主要源于2010年的一系列报道，当时武汉、江西、山东、北京等地的女婴被发现有激素检测超标等早熟症状，而这些婴儿均食用过圣元公司生产的奶粉。家长们因此怀疑圣元奶粉可能是导致婴儿性早熟的原因。具体事件如下：
媒体报道：多家媒体报道称武汉三名女婴家长称自己的孩子食用圣元奶粉后出现性早熟症状，这引起了社会的强烈关注新浪新闻。
家长怀疑：家长们怀疑圣元奶粉可能导致婴儿性早熟，因为食用该奶粉的婴儿出现了乳房长“硬核”等“性早熟”症状中国青年报。
圣元回应：圣元营养食品有限公司表示其产品绝对安全，并承诺将“主动配合各媒体就此事的报道，并向媒体通报事件进程”大众网。
卫生部调查：卫生部介入调查“奶粉事件”，并表示儿童性早熟成因复杂，尚且不能断定患者与特定的食物或者环境之间到底有多大关系中国政府网。
调查结果：卫生部最终通报“圣元乳粉疑致儿童性早熟”调查结果，称湖北3婴幼儿乳房早发育与食用圣元乳粉无关，目前市场上抽检的圣元奶粉未检出己烯雌酚和醋酸氯己烯雌酚平江县。
综上所述，圣元奶粉被怀疑与婴儿性早熟有关主要是因为当时食用该奶粉的婴儿出现了性早熟症状，但最终卫生部的调查结果显示圣元奶粉与婴儿性早熟无关。