神策军在唐代后期成为宦官控制朝政的重要工具，主要原因如下：
宦官掌握军权：宦官作为皇帝的家奴，最初是皇权的维护者。德宗对文武大臣失望后，将军权交给宦官，使宦官对皇权的依赖性逐渐弱化，开始掌握实权。宦官通过掌握神策军兵权，以神策军为工具控制皇权，从而获得对皇帝生、死、废立大权的控制[1][2][3]。
神策军的转变：神策军原为西北的戍边军队，后进入京师成为唐王朝的最重要禁军，负责保卫京师和戍卫宫廷以及行征伐事。宦官通过直接统帅神策军，安插宦官为神策军兵马使，使神策军成为宦官掌权甚至废立皇帝的主要工具[4][5]。
宦官的政治地位提升：宦官既掌军权，又参与朝廷政务机要，为其操纵君主废立提供了势力和权力上的双重机会。神策军设左、右神策军中尉各一人，枢密使设宦官两人，被并称“四贵”，进一步巩固了宦官的政治地位[6]。
神策军的腐化：唐穆宗以后，神策军渐渐腐化，战斗力下降，宦官集团利用这一机会加强对神策军的控制，使其成为宦官集团的政治工具[7]。
综上所述，神策军之所以在唐代后期成为宦官控制朝政的重要工具，是因为宦官通过掌握神策军兵权，直接统帅神策军，并利用神策军腐化的机会加强控制，从而获得对皇权的控制和操纵。