约翰·莫尼的性别研究对现代心理学产生了深远的影响。他提出了性别认同、性别角色和爱情地图等重要理论和专有名词，是最早研究性别流动和社会性别认同对个体影响的心理学家之一。莫尼的研究强调了性别认同的社会构建性，挑战了性别是单纯由生物学决定的观点。他的工作促进了对性别多样性的认识和接受，影响了性别研究和心理学的多个领域。
莫尼的研究还对性别发展理论产生了影响，他开发了性别发展的多层模型，并从染色体性别、荷尔蒙和心理社会因素等方面探讨了性别认同的形成。此外，他的研究还对跨性别者和双性人的心理健康和心理调整提供了见解，表明精神病理学的发生率非常低，这与预期相反。
综上所述，约翰·莫尼的性别研究不仅推动了心理学领域对性别认同、性别角色和性别多样性的理解，还促进了性别研究的学术和临床发展。他的理论和发现至今仍对现代心理学产生着重要影响。