毌丘俭选择屠杀丸都城的官员的原因主要是为了惩罚高句丽的统治集团，以及彻底削弱其政权。根据搜索结果中的资料，这场战争的起因是曹魏认为高句丽不遵守属国的规范，既征服其他的中国属国，更侵略中国郡县。因此，曹魏所作出的惩罚是针对其统治集团，甚至是最严酷的屠杀与毁掉其都城。毌丘俭在攻陷丸都城后，屠杀城内官员数千人，随后退兵。这一行动旨在通过摧毁高句丽的政治中心和统治阶层，来达到削弱其国力和控制力的目的。
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