2004年敏督利台风对台湾大学入学考试的影响主要体现在考试的举行和考生的参与上。根据搜索结果，以下是一些关键点：
考试如期举行：尽管台风来袭，2004年7月1日的大学入学指定科目考试（指考）自然组仍然如期举行。来源
考生受影响：台风导致许多考生因等待宣布延考而受到影响，部分考生在风雨中应试，考生与家长对此抱怨连连。来源
补救考试：对于受灾地区的考生，台湾教育部门安排了补救考试，以确保他们不会因台风而失去考试机会。来源
社会反响：各界对教育部和大考中心的处置提出了批评，认为在台风影响下仍然坚持考试的做法不妥。来源
综上所述，2004年敏督利台风对台湾大学入学考试造成了显著影响，主要表现在考试的举行和考生的参与上，尽管考试如期进行，但台风对考生的出行和考试状态造成了不利影响，教育部门也采取了补救措施以减轻影响。