参考资料

查理六世在位期间，法国在百年战争中失去了以下优势：

1. 领土丧失：查理六世在位期间，由于精神问题和国内派系斗争，法国失去了包括巴黎在内的大片领土，甚至一度连首都巴黎都落入英国手中。来源

2. 军事失利：在查理六世统治时期，法国军队在阿金库尔战役中遭受重大失败，法国的贵族骑士损失惨重。来源

3. 政治动荡：查理六世的精神问题导致国内权力斗争加剧，使得法国在政治上陷入混乱，无法形成统一对抗外敌的力量。来源

4. 王位继承问题：查理六世和亨利五世于1422年都先后去世，导致两国之间为了王位继承权爆发了激烈的斗争。来源

5. 经济负担加重：由于战争的持续，法国人民的负担加重，导致国家经济衰退。来源

综上所述，查理六世在位期间，法国在百年战争中不仅失去了大片领土和军事优势，政治上的不稳定和经济上的衰退也严重影响了法国的整体实力。