红色高棉政权期间，柬埔寨的知识分子和医疗系统遭受了严重的系统性破坏。以下是一些关键点：
知识分子的迫害：红色高棉试图通过系统地屠杀知识分子来创立一个纯粹的农业社会。他们认为城市是滋生罪恶的温床，并将大量城市居民驱逐到农村进行建设。在这一过程中，知识分子，包括教师、医生、技术人员等，被视为革命的敌人，遭到大规模的清洗和杀害。据估计，约有40万人被当作革命敌人杀害，其中许多是知识分子12。
医疗系统的摧毁：红色高棉废除了全部的教育系统和健康系统。从小学到高等教育都被摧毁，科学文化知识的传授被严厉禁止。医疗系统同样未能幸免，许多医院和卫生设施被关闭或破坏，医疗专业人员被杀害或流放，导致整个国家的医疗保健系统崩溃34。
经济和社会影响：由于知识分子和医疗系统的破坏，柬埔寨的经济和社会基础设施遭受了严重打击。专业知识和技能的流失，使得国家在教育、卫生、农业等多个领域的发展受到阻碍，影响了柬埔寨长期的经济恢复和社会稳定56。
综上所述，红色高棉政权对柬埔寨知识分子和医疗系统的破坏是系统性和毁灭性的，对柬埔寨社会造成了深远的影响。