高丽在元朝统治下的自治权经历了一系列的变化。最初，高丽成为元朝的附庸国，并一度受到元征东行省的控制。元朝通过保持对高丽官员的任命权来有效控制万户府，进而控制整个军队，这限制了高丽的自治权[1]。高丽王室与蒙古皇室联姻，高丽王室在元朝的政治地位大大提高，但洪氏家族的政治影响则逐步减弱，最终失去了影响力[7]。
随着元朝的衰落，高丽开始开展反元自主政策，摆脱了蒙古的干涉，并收复了失地。特别是在恭愍王时期，高丽利用元朝末年统治力下降和红巾军起义的机会，试图趁机脱离元朝控制[8]。到了高丽末期，高丽趁元朝无暇东顾之机，收复双城等州镇，并向北推进至咸兴、三散一带，并多次申明这些地区原本属于高丽[10]。
总体来看，高丽在元朝统治下的自治权经历了从受限到逐渐增强的过程，尤其是在元朝后期，高丽的自治权得到了显著提升。