道尔顿的原子理论是化学史上的一个重要里程碑，它提出了原子是物质的基本单位，不可分割，并且所有同种元素的原子在质量和性质上都是相同的。然而，随着科学的发展，一些道尔顿理论中的概念与现代科学不符，主要包括：
原子不可分割：道尔顿认为原子是不可分割的，但现代科学已经证明原子可以进一步分割成更小的粒子，如质子、中子和电子。
原子质量相同：道尔顿的理论认为同种元素的所有原子在质量和性质上都是相同的。然而，现代科学发现同种元素的原子可以有不同的同位素，它们的原子质量数不同。
原子间无空间：道尔顿的理论没有考虑到原子之间的空间，而现代科学知道原子内部有大量的空间，电子在原子核外的轨道上运动。
原子结构简单：道尔顿的理论将原子视为一个实心球，而现代科学揭示了原子的复杂结构，包括电子云和量子力学特性。
化学反应的解释：道尔顿的理论没有解释化学反应中原子如何重新排列，而现代化学理论如价键理论和分子轨道理论能够详细解释这些过程。
尽管道尔顿的理论在某些方面与现代科学不符，但它为化学的发展奠定了基础，并且启发了后来的科学家对原子结构和性质的进一步探索。