耶路撒冷宗主教区历史上多次迁移教座的原因主要与政治、宗教冲突和地区动荡有关。以下是一些关键点：
东西方教会分裂：1054年，东西方教会大分裂导致耶路撒冷宗主教区受到影响，教座迁移与教会内部的分歧和权力斗争有关[1]。
宗教战争和十字军东征：中世纪时期，宗教战争和十字军东征导致该地区政治和宗教格局不断变化，影响了宗主教区的稳定性，迫使教座迁移[1]。
奥斯曼帝国和欧洲势力的影响：16世纪至19世纪，奥斯曼帝国对该地区的影响以及欧洲势力的介入使得耶路撒冷宗主教区的地位和教座位置不断变化[1]。
教宗的决策：教宗庇护九世在1847年将教座迁回耶路撒冷并恢复宗主教区，显示了教宗对教座位置的直接影响和决策权[1]。
地区冲突和政治动荡：20世纪以来，中东地区的冲突和政治动荡，特别是以色列和巴勒斯坦的紧张关系，也对耶路撒冷宗主教区的稳定性产生了影响。
综上所述，耶路撒冷宗主教区历史上多次迁移教座，主要是由于宗教、政治和地区冲突的复杂交织。这些因素共同作用，导致教座位置的不断变化，以适应不断变化的历史背景和社会环境。
参考来源： [1] 天主教耶路撒冷宗主教区- 维基百科，自由的百科全书