安德洛尼卡一世的长子曼努埃尔·科穆宁不支持父亲夺取拜占庭帝国皇位的原因，根据搜索结果中的信息，可以归结为以下几点：
政治立场和道德考量：曼努埃尔·科穆宁可能出于对父亲安德洛尼卡一世残暴统治和政变行为的道德反对，不认同其夺取皇位的方式。网易文章提到，曼努埃尔并不支持父亲夺取拜占庭帝国皇位的做法1。
预言和宗教因素：可能存在某些宗教预言或教义影响了曼努埃尔的决策，使他不愿意支持父亲的政变。同一篇文章中提到，由于他的反对以及为了实现AIMA预言，曼努埃尔因此未被安德洛尼卡视为继承人1。
权力斗争和个人野心：安德洛尼卡一世的行为可能触动了曼努埃尔·科穆宁自身的权力和安全，导致他选择反对父亲。腾讯新闻的文章中提到，安德罗尼库斯（安德洛尼卡一世）是科穆宁皇族除了皇帝本人之外最有才干的成员，原本有希望得到皇位，因此对皇帝的安排不满2。
维护帝国稳定：曼努埃尔可能认为父亲的行动会破坏帝国的稳定，因此选择不支持。科穆宁王朝在曼努埃尔一世去世后迅速陷入内乱和衰退，说明了内部冲突对帝国稳定的破坏性3。
这些因素综合起来，构成了曼努埃尔·科穆宁不支持父亲夺取皇位的复杂背景。每个因素都反映了当时拜占庭帝国内部的权力斗争、家族纷争以及个人信仰和道德考量。