《云别传》与《三国志》对赵云的描述存在一些差异，这些差异主要体现在以下几个方面：
个人功绩和地位：《三国志》作为正史，对赵云的描述较为简略，没有过多渲染其个人功绩，而《云别传》则提供了更多关于赵云英勇事迹的细节，如两次救阿斗等，这使得赵云在民间传说中形象更加英勇。来源
与刘备的关系：《云别传》中提到刘备和赵云关系密切，经常同床眠卧，显示了他们之间深厚的信任和友谊。来源 而在《三国志》中，这种私人关系的细节较少被提及。
历史形象与文学形象的差异：《三国演义》等文学作品对赵云的描写更加夸张和理想化，使其成为“五虎上将”之一，而《三国志》中的赵云则没有这样的地位，这种差异导致了人们对赵云历史地位和功绩的不同看法。来源
争议产生的原因主要是：
史料价值和可信度：由于《三国志》作为正史，其记载被认为更具有史料价值，而《云别传》等后来的补充资料可能带有更多文学加工和夸张，导致人们对赵云的真实历史形象产生疑问。来源
文化渲染和民间传说：民间传说和文化渲染使得赵云的形象更加深入人心，但同时也可能偏离了历史事实，这种理想化的形象与正史记载之间的差异，引发了关于赵云真实地位和功绩的争议。来源
个人情感和历史解读：不同的人站在不同的角度，对赵云的评价和解读也会有所不同，这种主观性也加剧了关于赵云的争议。来源
综上所述，由于史料记载的差异、文化渲染以及个人情感和历史解读的不同，导致了《云别传》与《三国志》对赵云描述的不同，并引发了关于赵云的争议。