安德鲁三世在位期间面临的主要挑战包括：
王室职责的履行问题：查尔斯三世（安德鲁三世）是历史上宣告成为英国国王时年龄最大的一位。关于他在位时的日常工作，其中一个问题就是一长串的王室职务当中，有多少是他会亲自履行的。来源
王室成员减少的问题：国王患病是对英国王室的最新打击，王室的主要成员已经减少，有的是因为死亡（伊丽莎白和丈夫菲利普亲王），有的是因为丑闻（安德鲁王子），有的是因为自我流放（哈利王子）。来源
政治影响力问题：一位曾接受查尔斯游说的前内阁大臣说，彼时他并未感到很大压力。但他对新国王的记忆是，一个固执己见的人。他认为查尔斯带着他想要追求的预设观点而来。来源
这些挑战反映了安德鲁三世在位期间需要处理的复杂问题，包括王室内部的职责分配、成员减少带来的影响，以及他在政治上的影响力和角色。