佩德羅三世在治理西西里时面临的挑战主要包括:
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教皇的反对和政治斗争:法兰西籍教皇马丁四世只承认查理为西西里和那不勒斯的国王,查理也向佩德罗三世提出在波尔多决斗的挑战,但查理缺席不到,这反映了佩德罗三世在西西里统治时面临的政治斗争和教皇的反对。来源
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贵族的不满和特权问题:佩德罗在西西里的冒险行动在阿拉贡也不得人心,贵族们利用这一机会组织联盟,来保卫自己的特权。1283年,佩德罗授予他们所谓的广泛特权,即承认他们的习惯法,这显示了他在处理贵族不满和特权问题上的挑战。来源
这些挑战揭示了佩德罗三世在治理西西里时不仅要应对外部的政治压力,还要处理内部的贵族不满和特权问题。