嘉庆年间的王囊仙起义对清朝统治产生了以下深远影响：
社会矛盾激化：起义反映了当时清朝政治腐败、官僚贪污、民生疾苦的社会现实。天灾频繁、粮食减产导致民生凋敝，贫富差距加大，社会矛盾激化[1]。这场起义揭示了清朝统治下的社会矛盾和民族问题，迫使清廷重视并采取措施以缓和社会矛盾。
清朝军事力量的消耗：起义历时8个月，清廷为了镇压起义，不得不调动大量军队和资源，这无疑对清朝的军事力量和财政造成了一定的消耗[2]。
清朝统治的动摇：起义震惊了清廷，显示了清朝统治的脆弱性，尤其是在边远地区。清廷不得不重新审视和调整对少数民族地区的统治策略[3]。
民族意识的觉醒：王囊仙起义以布依族为主体，有苗、汉等多民族人民参加，反映了民族意识的觉醒和对清朝统治的不满[4]。这种民族意识的觉醒对后来的民族关系和清朝的民族政策产生了影响。
清朝政策的调整：起义后，清廷可能对民族政策进行了一定程度的调整，以缓和民族矛盾和防止类似起义的再次发生[5]。
综上所述，王囊仙起义不仅在当时对清朝统治造成了冲击，而且从长远来看，也促使清朝反思和调整其统治政策，尤其是在民族问题和社会矛盾的处理上。这场起义是清朝历史上的一个重要事件，对清朝的统治和社会结构产生了深远的影响。
[1] http://m.3233.cn/n/zqq4-162498.html [2] https://baike.baidu.com/item/%E7%8E%8B%E5%9B%8A%E4%BB%99/11025301 [3] http://www.gz-travel.net/rwgz/fcrw/qxn/201006/9540.html [4] http://www.gz-travel.net/rwgz/fcrw/qxn/201006/9540.html [5] http://www.historychina.net/qsyj/ztyj/shs/2005-05-30/25890.shtml