沃里克伯爵与玛格丽特王后最终选择结盟的原因主要是出于政治利益和对抗共同敌人的需要。根据搜索结果中的信息，爱德华四世在位头三年，沃里克掌握实权，但国王逐步独立行事，双方关系逐渐紧张。爱德华采用结盟的方式安抚过去的敌对贵族引起传统盟友沃里克强烈不满。沃里克与爱德华四世之间的矛盾最终导致沃里克转而支持兰开斯特家族，与玛格丽特王后结盟[1]。此外，玛格丽特王后为了保护国王“对抗他的敌人”，召集贵族到莱斯特集会，而沃里克伯爵接受了王后的要求回到了英格兰，他们在1470年10月3日，恢复了国王的地位[2]。这表明，面对共同的敌人和政治利益，曾经的敌人选择结盟是出于战略上的考量。