历史上被认为是种族灭绝的争议案例包括:
保加利亚1876年四月起义:超过15,000名手无寸铁的保加利亚平民被奥斯曼军队杀害,其中巴塔克大屠杀最为惨重。来源
纳粹大屠杀:二战中纳粹德国大规模屠杀犹太人,该词也被用于指称中国政府对待新疆维吾尔族人的行为,引发了巨大争议。来源
斯雷布雷尼察大屠杀:1995年7月,在波黑的斯雷布雷尼察发生了欧洲在二战后最严重的大屠杀,波黑塞族军警以及南联盟军队杀害了7000多名穆斯林。来源
美国对印第安人的种族灭绝:1864年11月29日,美国牧师约翰·奇文顿在科罗拉多州东南部的沙溪对印第安人进行屠杀,这是美国原住民历史上最臭名昭著的一次屠杀之一。来源
印尼1965-1966年种族灭绝:500,000印尼共产党(印尼共)党员和同情者遭遇大屠杀,这是上个世纪最鲜为人知的种族灭绝之一。来源
这些案例在国际社会中存在广泛的争议,不同国家和组织对于是否构成种族灭绝有不同的看法和立场。