参考资料

根据搜索结果，2006年京都市出版的文化遗产相关书籍中提到的重要历史遗迹包括：

1. 古京都遗址（京都、宇治和大津城）：从794年到1867年江户时代末期，京都一直是日本的首都和文化中心。在这座昔日首都的无数历史和文化财产中，有17处历史遗迹于1994年被注册为世界文化遗产。来源

2. 祗园祭：作为日本最具代表性的祭典之一，也是非物质文化遗产的京都祗园祭，已有1000多年的历史。来源

3. 正仓院：正仓院是日本奈良时代的仓库，收藏了许多珍贵的文物，对文物的修复种类、工艺以及所取得的成就进行了充分展示。来源

这些历史遗迹不仅代表了京都丰富的文化遗产，也是日本乃至世界文化的重要组成部分。