伊莎贝拉和斐迪南在宗教改革中采取了以下措施来加强王权：
建立西班牙宗教法庭制度：他们建立了西班牙宗教法庭制度，取代了教皇对西班牙宗教正统的文化领导权，加强了天主教君主的控制[1]。
成立西班牙宗教裁判所：伊莎贝拉一世在1478年成立了西班牙宗教裁判所，迫害非天主教人士并大力提升了王权[5]。
颁布阿尔罕布拉斯条约：1492年3月31日，伊莎贝拉签署了阿尔罕布拉敕令，宣布强行驱逐犹太人，大约有20万犹太人被赶出西班牙，剩下的一部分人被迫皈依了天主教，但他们仍然遭到宗教裁判所的严密监视[11]。
推行宗教改革和反异教徒运动：他们采取强烈宗教立场，试图使西班牙成为天主教国家，颁布宗教裁判所法令等[7]。
控制议会和削弱贵族权力：他们控制了议会，削弱了贵族的政治权力，建立常备军等，削弱了贵族势力，尤其地方机构改革后削弱了贵族对行政和司法的控制[3]。
这些措施在宗教改革中有效地加强了王权，使西班牙成为天主教国家，并巩固了君主的权威。
[1] 第四章西班牙帝国
[3] 崛起的“奇迹”背后：成功取决于“人”而不是“国”
[5] 伊莎贝尔一世(卡斯蒂利亚) - 维基百科
[7] 伊莎贝拉女王和斐迪南 - 起点中文
[11] 伊莎贝拉 - 文明5在线百科