尼西亚帝国在光复君士坦丁堡后逐渐失去安纳托利亚领土的原因主要有以下几点：
外部威胁和战争消耗：尼西亚帝国在光复君士坦丁堡后，面临着拉丁国家和东方异教徒的夹击，需要与马穆鲁克埃及等建立盟友关系以求生存1。同时，与蒙古帝国的多次联姻和外交活动也消耗了大量资源2。
内部矛盾和政治斗争：尼西亚帝国在收复君士坦丁堡之前是一个高度游牧性的安纳托利亚军事集团，过早收复君士坦丁堡导致其内部结构和重心发生变化，可能加剧了内部矛盾和政治斗争3。
经济衰退和资源分配问题：尼西亚帝国在收复君士坦丁堡后，需要将资源和军队从安纳托利亚西部转移至新首都，导致对安纳托利亚地区的控制力下降4。
突厥人的入侵和压力：安纳托利亚地区受到突厥人的持续入侵和压力，尼西亚帝国难以维持对该地区的控制5。
国力和版图的缩减：尼西亚帝国在收复首都后，国力和版图无法从之前的损失中恢复，导致对安纳托利亚的控制逐渐减弱6。
东西线局势失衡：光复君士坦丁堡后，帝国需要面对东西两线的压力，导致资源分配和战略重心的失衡，无法有效维持对安纳托利亚的控制7。
这些因素共同作用，导致尼西亚帝国在光复君士坦丁堡后逐渐失去了对安纳托利亚的领土控制。