大宗词汇比较法在历史语言学中面临的挑战主要包括：
理论基础的争议：大规模比较法因抛弃了构拟原始语和推理规则变化等传统手段而遭到大多数历史语言学家的否定[1]。这表明大宗词汇比较法在理论基础方面存在争议，特别是在如何准确构拟原始语和推理语言变化规则方面。
数据的局限性：由于历史资料的有限性，大宗词汇比较法在获取足够的、可靠的历史语言数据方面面临挑战。这限制了研究者对语言历史关系的深入分析和理解。
语言变化的复杂性：语言变化是一个复杂的过程，涉及多种因素，包括社会、文化、地理等。大宗词汇比较法可能难以全面捕捉这些复杂因素对语言变化的影响。
方法论的局限：传统的历史比较语言学方法在处理大规模跨语言的词汇比较时可能存在局限，尤其是在处理语言接触、借贷词以及语言融合等现象时。
技术挑战：随着计算语言学的发展，如何利用现代技术手段来提高大宗词汇比较法的效率和准确性，也是该领域面临的一个技术挑战。
综上所述，大宗词汇比较法在历史语言学中面临着理论基础、数据获取、语言变化复杂性、方法论局限以及技术挑战等多方面的问题。这些挑战需要通过跨学科合作、技术创新和理论发展来共同克服。
[1] 维基百科，自由的百科全书. (n.d.). 比较语言学. Retrieved from https://zh.wikipedia.org/zh-cn/%E5%8E%86%E5%8F%B2%E6%AF%94%E8%BE%83%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%AD%A6