参考资料

根纳季乌斯二世被穆罕默德二世任命为君士坦丁堡普世牧首的原因，根据搜索结果中的信息，可以归结为以下几点：

1. 政治与宗教的平衡：1454年，穆罕默德二世任命根纳季乌斯二世为普世牧首，这一举措被史学家认为是穆罕默德二世试图在政治和宗教之间寻求平衡。来源

2. 东正教与罗马教会的关系：根纳季乌斯二世曾反对东正教和罗马教会的合并，这可能使他在穆罕默德二世眼中成为一个合适的人选，因为穆罕默德二世可能希望保持东正教的独立性，以巩固对新征服地区的控制。来源

3. 对前任牧首的反对：根纳季乌斯二世被任命可能与他反对前任牧首的立场有关，这可能使得穆罕默德二世认为他是一个可以依赖的宗教领袖，有助于巩固奥斯曼帝国在新征服地区的统治。来源

4. 恢复教籍：穆罕默德二世可能利用根纳季乌斯二世来恢复那些被前任牧首革除教籍的人，以此来巩固他的统治和影响力。来源

这些信息提供了关于根纳季乌斯二世被任命为君士坦丁堡普世牧首背后的可能动机和历史背景。