尼尼微之战对拜占庭帝国的长期影响主要体现在以下几个方面：
国力消耗：长期的战争使得拜占庭帝国和萨珊波斯都精疲力尽，拜占庭帝国的胜利并没有给他们带来实际的益处[1]。这导致帝国在随后的几年中，面对阿拉伯人的扩张时，无力进行有效的抵抗。
战略劣势：尼尼微之战后，拜占庭帝国的战略地位受到了不利影响，因为波斯人可以不用顾及幼发拉底河以外的区域，而是从埃德萨及其周边对拜占庭帝国发动进攻[2]。
领土和文化损失：埃及先后落入萨珊波斯人和阿拉伯人之手，拜占庭人失去了亚历山大里亚这一重要的教育、学术中心[4]。这不仅影响了拜占庭的文化发展，也削弱了其在地中海地区的影响力。
内部动荡：斯拉夫人的南下、波斯的入侵以及兵变等事件使得拜占庭处于内忧外患之中，福卡斯领导的叛军夺取了政权，查士丁尼王朝宣告终结[7]。
对近东地区统治的削弱：波斯军摧毁了拜占庭帝国对近东地区的统治，断绝了当地与君士坦丁堡的联系，拜占庭帝国从此以后不再能够有效控制这一地区[8]。
综上所述，尼尼微之战虽然在短期内为拜占庭帝国带来了胜利，但从长远来看，这场战争极大地消耗了帝国的国力，削弱了其在战略上的地位，导致了领土和文化上的损失，以及内部的动荡和对近东地区控制力的下降，最终影响了拜占庭帝国的长期稳定和繁荣。
[1] 拜占庭—萨珊战争(602年—628年) - 维基百科 [2] 拜占庭与两河流域文明的互动 - 中国社会科学杂志社 [4] 【文萃】修昔底德传统与拜占庭帝国的历史书写 - 中国社会科学网 [7] 带你一次性搞懂世界历史——拜占庭篇 - 360Doc [8] 大征服：阿拉伯帝国何以征服后罗马世界？ - 澎湃新闻