意大利城邦的共和制度在罗马帝国灭亡后得以保留的原因可以从以下几个方面进行理解：
政治结构的延续性：根据搜索结果中的“中世纪的意大利- 维基百科，自由的百科全书”1，中世纪晚期，意大利及其散乱的政治状况稍微改善了一些，许多小城邦被较大城邦所兼并或控制。这表明即使在罗马帝国灭亡后，意大利城邦的政治结构仍然得以保留，并在一定程度上继续发展。
城市公社的兴起：从“刘耀春：意大利城市政治体制与权力空间的演变(1000—1600)”2中我们了解到，中世纪晚期至文艺复兴时期，意大利北部和中部的大部分城市公社逐渐从共和制演变为由领主及其家族统治的领主制。这说明城市公社在罗马帝国灭亡后成为了政治活动的重要场所，共和制的政治传统在这些城市公社中得以保留。
独立地位的获得：根据“西欧中世纪的城市自治- 法信- 懂法，更懂法律人”3，到了13世纪中期，许多城市共和国获得了独立的地位，拥有了保护选举的成文宪法和自治的政府。这进一步证明了意大利城邦在罗马帝国灭亡后不仅保留了共和制度，而且还发展出了一定程度的自治和独立性。
外部势力的影响：从“圣马力诺，“小身材”，大诱惑 - 新民周刊”4中我们了解到，西罗马帝国灭亡后，意大利陷入了长达近1400年的四分五裂状态。这种分裂状态使得各个城邦能够保持一定程度的自治和独立，从而保留了共和制度。
文化和思想的传承：意大利城邦在罗马帝国灭亡后得以保留共和制度，也与其文化和思想的传承有关。罗马法和古典文化在意大利城邦中得以保存和发扬，为共和制的存续提供了思想基础。
综上所述，意大利城邦的共和制度之所以能在罗马帝国灭亡后得以保留，是由于政治结构的延续性、城市公社的兴起、独立地位的获得、外部势力的影响以及文化和思想的传承等多方面因素共同作用的结果。