美国在20世纪初军事占领尼加拉瓜的原因主要与以下几个因素有关：
控制运河建设：美国军事干预尼加拉瓜的目的是为了防止除美国以外的任何其他国家修建尼加拉瓜运河。维基百科提到，美国占领尼加拉瓜是香蕉战争的一部分，其意图是阻止美国之外的其他任何国家插手尼加拉瓜运河的开凿。
政治动荡与政权更迭：美国参与尼加拉瓜的政权更迭，与当地的自由党和保守党冲突有关。迪亚斯与美国结盟，遭到尼加拉瓜民众和梅纳反对，迪亚斯自立总统后，梅纳及自由党反抗，美国派军进入并占领尼加拉瓜。维基百科
保护美国利益：美国在尼加拉瓜政治动乱期间保护美国人的生命和利益。珍稀原始典藏档案显示，美国对尼加拉瓜军事干预的意图是阻止美国之外的其他任何国家插手尼加拉瓜运河的开凿，尼加拉瓜在1916年《布里安·查莫罗条约》下享有准受保护国地位。
地缘政治影响：美国与尼加拉瓜反政府武装结成庇护—代理关系试图推翻桑地诺政府，并削弱苏联在中美洲的地缘影响力。理解国际冲突中的庇护—代理关系
综上所述，美国在20世纪初军事占领尼加拉瓜的原因涉及控制运河建设、政治动荡与政权更迭、保护美国利益以及地缘政治影响等多个方面。