中国历史上正统性存在争议的王朝主要包括：
- 秦朝：由于统治残暴和统一中国的时间较短，其正统性受到质疑。
- 隋朝：同样因为统治较为残暴且统一时间较短，正统性较低。
- 元朝：由于非起源于中原地区且由蒙古族统治，存在“元清非中国论”的观点，认为元朝不属于中国王朝。
- 清朝：同样因为由满族统治，也存在类似的争议。
- 辽朝、金朝：在接受华夏文明后，都以正统相标榜，但存在德运之争和正统性问题。
- 宋朝、辽朝、金朝：在这三个王朝并存时期，都自称华夏正统，存在争议。
这些争议主要源于古代对正统性的标准和现代观念的差异，以及民族、文化和政治因素的交织。每个王朝的正统性都有其支持者和反对者，这些争议至今仍是历史学界讨论的话题。搜狐新闻、澎湃新闻、网易等来源提供了对这些王朝正统性争议的讨论。