《旧五代史》的清代辑本存在一些不足之处，主要包括：
缺漏脱误：清代辑本在辑录过程中存在缺漏和脱误，这是因为原始材料的不完整性以及辑录技术的局限性导致的。陈尚君:《旧五代史》重辑的缘由和方法 - 豆瓣
人为篡改：清代辑本可能存在人为篡改的情况，这影响了史料的真实性和准确性。陈尚君:《旧五代史》重辑的缘由和方法 - 豆瓣
非原书：清代乾隆年间修《四库全书》时，邵晋涵从《永乐大典》和《册府元龟》等书中辑出《旧五代史》，这个辑本并非原书，因此存在一定的差异。天下几人能及君_中华读书报_光明网
史料来源问题：由于《旧五代史》一度湮没于历史长河中，直到编《四库全书》时，才从《永乐大典》中重新辑出，因此史料来源存在问题，影响了辑本的完整性和准确性。正本消失副本流散《永乐大典》600年风雨飘摇今何在 - 新华网
这些不足之处提示我们在利用《旧五代史》清代辑本进行学术研究时，需要谨慎对待，结合其他史料进行综合分析，以获得更准确的历史认识。