乌穆尔贝伊的海军之所以成为教宗克勉六世发动士麦那十字军东征的目标，主要原因在于乌穆尔贝伊控制了爱琴海和地中海东部的海域，对基督教国家构成了威胁。乌穆尔贝伊是土耳其的一位埃米尔，他在13世纪末扩张势力，建立了一个强大的海军力量，这直接影响了基督教国家在地中海的利益，尤其是贸易路线和朝圣者前往耶路撒冷的安全。
根据搜索结果中的维基百科条目“十字军东征”[1]，十字军东征主要是天主教会势力对穆斯林统治的西亚地区作占领并建立了一些基督教国家。乌穆尔贝伊的海军力量扩张，威胁到了基督教国家在地中海的利益，这促使教宗克勉六世发动士麦那十字军东征，以削弱乌穆尔贝伊的势力，保护基督教国家的利益和安全。
此外，乌穆尔贝伊的海军还攻击了基督教的船只和岛屿，进一步激化了双方的矛盾。教宗克勉六世发动士麦那十字军东征的目的，在于消除这一威胁，确保基督教国家在地中海的贸易和宗教活动不受影响。
综上所述，乌穆尔贝伊的海军之所以成为教宗克勉六世发动士麦那十字军东征的目标，是因为它直接威胁到了基督教国家在地中海的利益和安全，包括贸易路线的控制和朝圣者的安全。这一行动反映了中世纪时期宗教势力与地缘政治之间的复杂关系。
[1] 维基百科，自由的百科全书：https://zh.wikipedia.org/zh-cn/%E5%8D%81%E5%AD%97%E8%BB%8D%E6%9D%B1%E5%BE%81