尼日利亚在1914年合并为一个单一的殖民地时保留了三个主要地区的区域自治，主要原因如下：
民族和文化多样性：尼日利亚是一个多民族国家，拥有超过250个民族和500种语言。尼日利亚殖民地- 维基百科。保留区域自治有助于维护这些不同民族和文化群体的独特性和自治权。
行政管理效率：由于尼日利亚的广阔地域和民族多样性，万国图志｜非洲首富、黑人一哥：尼日利亚提到，殖民政府通过维持各民族各自为政、互不干扰的局面，按照豪萨-富拉尼族、伊博族、约鲁巴族三大主体民族聚居地划分为北区、西区、东区，这样的划分有助于提高行政管理的效率和效果。
避免冲突和不稳定：保留区域自治可以减少不同民族和地区之间的潜在冲突，第五章非洲对欧洲资本主义发展的贡献——殖民时期中提到，殖民政府通过法律、税务和强制要求的干预迫使非洲人采取一种有利于资本主义利润的方式，同时通过维持区域自治来避免大规模的反抗和冲突。
经济利益：殖民政府占领非洲土地时，达到了控制资源和劳动力的目的。第五章非洲对欧洲资本主义发展的贡献——殖民时期。通过保留区域自治，殖民政府可以更有效地控制和利用这些资源。
综上所述，尼日利亚殖民地在1914年合并时保留三个主要地区的区域自治，主要是为了管理上的便利、维护社会稳定、尊重民族多样性以及经济利益的考量。