罗马尼亚在中世纪时期通过几种方式在奥斯曼帝国的控制下保持了一定程度的独立性：
内部自治权：根据维基百科的资料，尽管摩尔多瓦、瓦拉几亚和特兰西瓦尼亚受到奥斯曼帝国的控制，但它们保留了完整的内部自治权[1]。这意味着这些地区在行政管理和内部事务上拥有一定的自主性。
附庸国地位：罗马尼亚的一些地区如瓦拉几亚和摩尔多瓦逐渐成为奥斯曼帝国的附庸国，尽管名义上保持自治，但它们需要向奥斯曼帝国进贡，并在军事上支持奥斯曼[7]。这种附庸关系使得罗马尼亚地区在一定程度上保持了自治，同时避免了被直接吞并。
利用大国对抗：特兰西瓦尼亚公国的独立部分归功于奥斯曼帝国与哈布斯堡家族的对抗。奥斯曼帝国“保护”下的附庸国特兰西瓦尼亚，因其地理位置和政治局势，能够在两大势力间保持一定的独立性[8]。
民族主义运动：19世纪，民族主义兴起，在1877年的俄土战争后，罗马尼亚获得完全独立的机会[3]。这标志着罗马尼亚人民在追求独立的过程中发挥了重要作用。
社会和经济改革：在18世纪，受到奥斯曼帝国影响的希腊人法纳里奥人对瓦拉几亚和摩尔多瓦进行了社会和经济改革，这可能增强了这些地区的自主性[5]。
综上所述，罗马尼亚在中世纪时期通过保持内部自治、作为附庸国与奥斯曼帝国的松散联盟、利用大国间的对抗、民族主义运动以及进行社会和经济改革等方式，在奥斯曼帝国的控制下保持了一定程度的独立性。这些因素共同作用，使得罗马尼亚能够在强大的奥斯曼帝国影响下保持自身的特色和自治权。