数字史学的发展引发了多方面的质疑，主要集中在以下几个方面：
数据的不确定性和解释的开放性：由于人文数据具有明显的不确定性和解释的开放性特征，技术与媒介应用于文化遗产产生了对于严谨性和真实性的质疑[1]。
真实性问题：数字时代对文学带来的重要冲击之一，就是到底何为“真实”。肉体与机械、真实与虚拟、人的感受与机器的算法，这些昔日的二元对立概念杂糅在一起，重构为复杂的问题[2]。
技术方法的引入：有学者担忧数字史学在重视技术方法引入的同时，可能会忽视历史研究的人文关怀和深度思考[3]。
数据驱动的问题：数字史学强调“数据驱动”，可能忽略了历史研究中对历史事件和人物的深入理解和解释[4]。
权威性和真实性的质疑：如果现代教育的权威性受到质疑；学习过程的真实性受到质疑；创造性内容生产行为的权威性受到质疑，并导致知识生产者失去权威性，就会扰乱社会秩序[5]。
数字史学的方法论问题：随着数字工具越来越方便实用，数字史学得到了进一步发展，但同时也带来了方法论的问题，如何确保研究的科学性和客观性成为关键[6]。
这些质疑反映了数字史学在发展过程中需要面对和解决的问题，以确保其研究的有效性和可靠性。