西班牙殖民统治对古巴原住民产生了深远的影响，具体包括：
文化同化：西班牙文化在殖民时期对古巴原住民文化产生了深远影响，例如古巴原住民开始信仰基督教，学习西班牙语等古巴帝国的历史和文化：原住民的多元性，及历史成因与影响（上）。
人口锐减：由于战争、疾病和强迫劳动，古巴原住民人口大量减少。不愿皈依基督教的原住民被西班牙殖民者强迫淘金，1529年在古巴爆发的麻疹杀死了大量的原住民古巴- 维基百科，自由的百科全书。
经济剥削：西班牙殖民者对原住民实行经济剥削，例如强迫他们从事金矿劳动，这导致原住民的生活条件恶化殖民主义与发展：西班牙殖民地与。
社会结构变化：西班牙殖民统治改变了古巴的社会结构，原住民被纳入西班牙的封建体系中，失去了原有的社会地位和权利拉丁美洲国家的独立 - Baripedia。
反抗与独立斗争：19世纪中期起，古巴人开始反抗西班牙殖民统治，要求独立。古巴人民进行了第二次独立战争，展现了对西班牙统治的不满和争取民族独立的决心历史 - 中国社会科学院拉丁美洲研究所。
综上所述，西班牙殖民统治对古巴原住民产生了深刻的文化、社会和经济影响，导致原住民人口锐减、文化同化、经济剥削和社会结构变化，同时也激发了古巴人民争取民族独立的斗争。