比萨共和国的独立结束于1406年，当时比萨被佛罗伦萨共和国征服。根据搜索结果中的信息，比萨共和国在中世纪是意大利中部重要的海上共和国，但在与佛罗伦斯的长期斗争中逐渐衰弱。特别是在十四世纪末，比萨共和国的力量被严重削弱，最终在1406年失去了独立，被佛罗伦萨共和国吞并。这一事件标志着比萨共和国独立的结束，比萨成为了佛罗伦萨领土的一部分。
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