蔡邕在董卓时期的政治立场和行为存在一些争议，主要体现在以下几个方面：
董卓的重用：蔡邕因其才学受到董卓的敬重，并被提拔至高位。据《后汉书·蔡邕列传》记载，“卓重邕才学，厚相遇待”，董卓对蔡邕“甚见敬重。举高第，补侍御史，又转持书御史，迁尚书。三日之间，周历三台。”1 这表明蔡邕在董卓时期得到了快速的升迁。
政治立场的分歧：蔡邕的政治立场与王允等其他官员存在分歧。王允陷害蔡邕的原因既有政治立场的分歧，也有权力斗争的需要2。蔡邕在董卓死后为其哭悼，这被王允视为不可接受的行为，导致王允对蔡邕的陷害3。
权力斗争的牺牲品：蔡邕被王允陷害，部分原因是王允为了立威和政治目的。王允可能出于嫉妒或政治需要，利用蔡邕与董卓的关系作为攻击的把柄4。
社会风气的影响：蔡邕的遭遇也受到了当时社会风气的影响。在董卓死后，蔡邕因其与董卓的关系而受到牵连，这反映了当时政治斗争的残酷性5。
综上所述，蔡邕在董卓时期的政治立场和行为因与董卓的关系而备受争议，最终导致他被王允陷害。这些争议不仅涉及政治立场的分歧，还与权力斗争和社会风气有关。