美浓地区在清治末期的水稻种植经历了一些变化。根据搜索结果，以下是一些关键点：
水稻种植面积变化：近30年来洞庭湖地区水稻种植面积演变的影响因素分析表明，与一季稻播种面积相比，1987—2017年大部分地区双季稻播种面积呈先降后升和持续下降的两种变化发展趋势。这可能暗示了水稻种植模式的调整和优化来源。
水稻产量变化：1980—2018年中国水稻生产变化的时空格局研究表明，水稻总产量年际变化呈现3个阶段：波动上升时期（1980—1997年），除广东省显著下降外，大部分省份显著增加；显著下降时期（1998—2003年），南方地区下降较快；恢复增长时期（2004—2018年），水稻产量整体呈现恢复性增长来源。
气候变化影响：未来气候变化对我国南方水稻主产区季节性干旱的影响评估指出，水稻的季节性干旱均呈下降趋势，特别是晚稻季节性干旱减少25万km²，几乎占晚稻种植面积的20%。这表明气候变化对水稻种植有显著影响来源。
种植北界迁移：气候带北移，农业种植版图的变化与隐忧提到，过去30年间，中国水稻种植北界呈显著地向高纬度、高海拔地区迁移的趋势。其中，向高纬度地区平均迁移了24.93公里，最大迁移距离为88.01公里来源。
综上所述，美浓地区在清治末期的水稻种植可能经历了种植面积和产量的波动，以及受气候变化影响的季节性干旱变化。这些变化可能与种植模式的调整、气候变化的影响以及种植北界的迁移有关。