法兰西岛方言理论在现代语言学中不再被重视的原因可能与以下几个因素有关：
语言政策和民族国家建构：随着近代民族国家建构的过程，各国政府为了强化国民的政治与文化认同，推行了本国语言政策。这些政策实践中的利弊得失，为我们提供了宝贵经验。语言、民族国家建构和国家语言政策 - 学术月刊。
方言与标准语的关系变化：随着时间的推移，标准语发源地的方言也会产生新变化。但标准语时常有人为规定的因素，其变化往往跟不上方言的脚步，结果标准语发源地的人说话就不再那么标准。到底哪里的普通话最标准？ - 精品阅读- 新浪。
现代语言学的发展：用现代语言学的眼光来研究汉语方言，肇始于19世纪中期以后纷至沓来的西洋传教士，他们用西方语言学的学理和概念来记录和分析汉语方言的语音，记录和整理方言。游汝杰:社会语言学与方言学专题讲义 - 教师之友网。
文化和语言的变迁：近现代文化变迁的根本特征，使我诉诸了20世纪80年代社会理论中相关于国族新文化的论述。这些既使我的叙述不同于西方“民间宗教人类学”，又不同于20世纪前期的“...”。他乡故土间：我的身游、心游与“乡愁”。
综上所述，法兰西岛方言理论在现代语言学中不再被重视，可能是因为民族国家建构过程中语言政策的影响、方言与标准语关系的变化、现代语言学的发展以及文化和语言变迁等因素。