詹姆斯·库克船长在他的航行中对新西兰和澳大利亚的探索做出了重大贡献，具体包括：
- 新西兰的探索：
- 库克船长是首位环绕新西兰航行的航海家，他证实了新西兰不是传说中的南方大陆，并且绘制了新西兰的精确地图。1
- 澳大利亚的探索：
- 库克船长首次登陆澳大利亚东岸，并绘制了澳大利亚东岸的地图，为欧洲人首次发现大堡礁，并对该地区的动植物、地形地貌进行了详细记录。5
- 他把托雷斯海峡的存在公诸于世，描绘了澳大利亚大陆的大致轮廓，证明新西兰并不是“南大陆”的一部分。8
- 太平洋岛屿的探索：
- 库克船长为新西兰与夏威夷之间的太平洋岛屿绘制了大量地图，这些地图的精确度极高。1
- 科学与地理学的贡献：
- 库克船长的航行为大洋——特别是太平洋的地理学知识增添了新的内容，他的测量及绘图工作对后世的地理学和航海学有着深远的影响。7
综上所述，詹姆斯·库克船长的航行不仅为新西兰和澳大利亚的地理发现做出了重大贡献，也为太平洋地区的地图绘制和科学探索提供了宝贵的资料。