萨摩斯军区作为拜占庭帝国的海上军区之一，其主要职责是维护海上安全和防御。根据搜索结果，军区制是拜占庭帝国中期实行的军政合一的区划制度，其主要特征是以军区代替行省，亦农亦兵，由主管军事的将军进行统治。军区获得相应土地，建立军屯制度，将自由农民编入军队，分配其世袭份地，让其成为“兵农合一”的屯田兵，向国家提供军事服务。[1] 因此，萨摩斯军区的职责包括了海上防御、保护海上航线、维护帝国的海上利益，以及在需要时提供军事支持和兵力。[2] 这种制度有助于拜占庭帝国抵挡周边民族的进攻，包括阿拉伯帝国的海上威胁。[3]