纪念馆的设计选择将展馆空间隐藏于地下的原因可能包括以下几点：
尊重和保护地面环境：如地中美术馆的设计，为了不破坏濑户内海的美丽景色，选择将大部分建筑隐藏在地下日本国家旅游局。
纪念性和象征意义：某些纪念馆通过将展馆空间隐藏于地下，来表达对历史事件的纪念和对遇难者的尊重，如9.11纪念博物馆的设计知乎。
空间利用和结构设计：地下空间可以更灵活地设计展览空间，不受地面环境限制，同时可以利用地下的稳定性和安全性ArchDaily。
光线和氛围营造：地下空间可以通过设计引入自然光或人工光，创造出独特的展览氛围，如贝聿铭先生在其他博物馆项目中运用的建筑语言ArchDaily。
环境融合和历史对话：地下空间的设计可以更好地与周围环境融合，同时与历史进行对话，如华茂艺术教育博物馆的设计Archiposition。
综上所述，纪念馆将展馆空间隐藏于地下的设计选择，既考虑了对环境的尊重和保护，也兼顾了纪念性、空间利用、光线氛围营造以及与环境和历史的融合。