密克罗尼西亚联邦实现独立的过程主要通过与美国签订《自由联系条约》来完成。根据搜索结果中的信息，以下是关键步骤和细节：
密克罗尼西亚联邦的成立：1979年5月10日，密克罗尼西亚联邦正式成立[2]。
签订《自由联系条约》：1982年，密克罗尼西亚联邦与美国正式签订了《自由联系条约》[1][2][3]。
条约生效与独立：1986年11月3日，《自由联系条约》正式生效，密克罗尼西亚联邦根据该条约获得内政、外交自主权，并正式从联合国托管状态独立为主权国家[1][2][3][4]。
安全防务：尽管密克罗尼西亚联邦获得了内政和外交的自主权，但其安全防务仍然由美国负责[3]。
通过这一过程，密克罗尼西亚联邦实现了独立，成为一个拥有内政和外交自主权的主权国家，但在国防方面仍与美国保持紧密联系。